เมื่อออกใบกำกับภาษีผิด ไม่ว่าความผิดพลาดจะเกิดจากผู้ออกใบกำกับภาษีเอง หรือ ลูกค้าแจ้งข้อมูลผิด  การ ‘แก้ไขใบกำกับภาษี’ เป็นสิ่งที่ทำได้ค่อนข้างยาก เนื่องจากเป็นเอกสารสำคัญในระบบภาษีมูลค่าเพิ่ม ซึ่งไม่สามารถแก้ไขใบกำกับภาษีได้โดยตรง หากมีการเปลี่ยนแปลงข้อมูลผู้ประกอบการต้องยกเลิกใบกำกับภาษีฉบับเดิม และจัดทำใบกำกับภาษีฉบับใหม่ที่ถูกต้อง โดยให้ดำเนินการตาม
หลักเกณฑ์ของมาตรา 86/4 แห่งประมวลรัษฎากร ประกอบกับข้อ 25 ของคำสั่งกรมสรรพากร ที่
ป.86/2542 เรื่อง หลักเกณฑ์การจัดทำใบกำกับภาษีตามมาตรา 86/4 และมาตรา 86/5 แห่ง
ประมวลรัษฎากร เฉพาะที่มีลักษณะเป็นแบบเต็มรูป ลงวันที่ 19 กรกฎาคม พ.ศ. 2542 (อ้างอิง: https://www.rd.go.th/24677.html)